MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Escherichia coli O83:H1 str. NRG 857C plasmid pO83_CORR

Total Repeats: 3067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017659	AGC	2	6	13	18	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017659	CAA	2	6	57	62	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017659	TGG	2	6	149	154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017659	GGA	2	6	173	178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017659	CGA	2	6	218	223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017659	A	6	6	223	228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017659	CCA	2	6	360	365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_017659	GAT	2	6	403	408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017659	C	10	10	459	468	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10	NC_017659	CGA	2	6	572	577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017659	GCTG	2	8	599	606	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017659	ATC	2	6	684	689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017659	GCC	2	6	741	746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_017659	AG	3	6	819	824	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017659	GTT	2	6	869	874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017659	ACG	2	6	942	947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017659	AT	3	6	956	961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017659	TGG	2	6	990	995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017659	GCC	2	6	1019	1024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_017659	TGA	2	6	1083	1088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017659	A	6	6	1176	1181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017659	ACCTG	2	10	1351	1360	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_017659	TCG	2	6	1364	1369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017659	CA	3	6	1432	1437	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017659	ATG	2	6	1485	1490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017659	A	6	6	1524	1529	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017659	ATT	2	6	1556	1561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017659	CAG	2	6	1579	1584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017659	GCT	2	6	1625	1630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017659	AGC	2	6	1755	1760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017659	TTA	2	6	1811	1816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017659	ATT	2	6	1856	1861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017659	TGT	2	6	1882	1887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017659	AACA	2	8	1909	1916	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017659	TTAC	2	8	1937	1944	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017659	GAT	2	6	1970	1975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017659	GT	3	6	1981	1986	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017659	GTT	2	6	2015	2020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017659	CTGA	2	8	2169	2176	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017659	GCA	2	6	2209	2214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017659	CTG	3	9	2248	2256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017659	TTTG	2	8	2321	2328	0 %	75 %	25 %	0 %	387615191
43	NC_017659	CT	3	6	2338	2343	0 %	50 %	0 %	50 %	387615191
44	NC_017659	TGT	2	6	2350	2355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387615191
45	NC_017659	GGA	2	6	2418	2423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387615191
46	NC_017659	TGG	2	6	2455	2460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387615191
47	NC_017659	CGC	2	6	2468	2473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387615191
48	NC_017659	CCA	2	6	2504	2509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387615191
49	NC_017659	A	7	7	2523	2529	100 %	0 %	0 %	0 %	387615191
50	NC_017659	TTC	2	6	2562	2567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387615191
51	NC_017659	GAA	2	6	2571	2576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387615191
52	NC_017659	TGG	2	6	2590	2595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387615191
53	NC_017659	GGC	2	6	2611	2616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615191
54	NC_017659	TCA	2	6	2623	2628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615191
55	NC_017659	GCC	2	6	2664	2669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387615191
56	NC_017659	TCG	2	6	2762	2767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615191
57	NC_017659	CAC	2	6	2785	2790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387615191
58	NC_017659	CCG	2	6	2817	2822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387615191
59	NC_017659	ACG	2	6	2842	2847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615191
60	NC_017659	ATT	2	6	2856	2861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387615191
61	NC_017659	TGG	2	6	2907	2912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387615191
62	NC_017659	GA	3	6	2913	2918	50 %	0 %	50 %	0 %	387615191
63	NC_017659	CTG	2	6	2937	2942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615191
64	NC_017659	ATC	2	6	3030	3035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615191
65	NC_017659	TCAT	2	8	3142	3149	25 %	50 %	0 %	25 %	387615191
66	NC_017659	GTT	2	6	3243	3248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387615191
67	NC_017659	CAA	2	6	3317	3322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387615191
68	NC_017659	AGC	2	6	3353	3358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615191
69	NC_017659	GGC	2	6	3365	3370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615191
70	NC_017659	T	6	6	3513	3518	0 %	100 %	0 %	0 %	387615192
71	NC_017659	GGA	2	6	3556	3561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387615192
72	NC_017659	GC	3	6	3619	3624	0 %	0 %	50 %	50 %	387615192
73	NC_017659	GTG	2	6	3658	3663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387615192
74	NC_017659	GCTG	2	8	3687	3694	0 %	25 %	50 %	25 %	387615192
75	NC_017659	CTG	2	6	3706	3711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615192
76	NC_017659	TGGC	2	8	3763	3770	0 %	25 %	50 %	25 %	387615192
77	NC_017659	T	7	7	3792	3798	0 %	100 %	0 %	0 %	387615192
78	NC_017659	GCA	2	6	3855	3860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615192
79	NC_017659	TGCGC	2	10	3918	3927	0 %	20 %	40 %	40 %	387615192
80	NC_017659	GCA	2	6	3963	3968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615192
81	NC_017659	CTG	2	6	3979	3984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615192
82	NC_017659	TTA	2	6	4017	4022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387615192
83	NC_017659	TCG	2	6	4073	4078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615192
84	NC_017659	CGT	2	6	4120	4125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615192
85	NC_017659	TG	3	6	4222	4227	0 %	50 %	50 %	0 %	387615192
86	NC_017659	CCA	2	6	4322	4327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387615192
87	NC_017659	CTG	2	6	4360	4365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615192
88	NC_017659	CGG	2	6	4371	4376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615192
89	NC_017659	GGTC	2	8	4379	4386	0 %	25 %	50 %	25 %	387615192
90	NC_017659	GATC	2	8	4398	4405	25 %	25 %	25 %	25 %	387615192
91	NC_017659	GGA	2	6	4548	4553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387615192
92	NC_017659	ACTGGA	2	12	4587	4598	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387615192
93	NC_017659	ACC	2	6	4616	4621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387615192
94	NC_017659	GACA	2	8	4627	4634	50 %	0 %	25 %	25 %	387615192
95	NC_017659	GC	3	6	4662	4667	0 %	0 %	50 %	50 %	387615192
96	NC_017659	GGT	2	6	4683	4688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387615192
97	NC_017659	TGC	2	6	4724	4729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615192
98	NC_017659	TCG	2	6	4821	4826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615192
99	NC_017659	CGG	2	6	4910	4915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615192
100	NC_017659	GCT	2	6	4936	4941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615192
101	NC_017659	CGG	2	6	5019	5024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615192
102	NC_017659	GAT	2	6	5086	5091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615192
103	NC_017659	ACC	2	6	5092	5097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387615192
104	NC_017659	TGC	2	6	5168	5173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615192
105	NC_017659	AGCC	2	8	5208	5215	25 %	0 %	25 %	50 %	387615192
106	NC_017659	TGG	2	6	5243	5248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387615192
107	NC_017659	GC	3	6	5275	5280	0 %	0 %	50 %	50 %	387615192
108	NC_017659	TGA	2	6	5300	5305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615192
109	NC_017659	CAG	2	6	5449	5454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615192
110	NC_017659	GTCAC	2	10	5479	5488	20 %	20 %	20 %	40 %	387615192
111	NC_017659	CGC	2	6	5520	5525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387615192
112	NC_017659	CTG	2	6	5527	5532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615192
113	NC_017659	GCA	2	6	5577	5582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615192
114	NC_017659	ATC	2	6	5620	5625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615192
115	NC_017659	CGC	2	6	5697	5702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387615192
116	NC_017659	GCG	2	6	5707	5712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615192
117	NC_017659	TGC	2	6	5756	5761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615192
118	NC_017659	CT	3	6	5829	5834	0 %	50 %	0 %	50 %	387615192
119	NC_017659	CCA	2	6	5870	5875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387615192
120	NC_017659	CGC	2	6	5898	5903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387615192
121	NC_017659	CGC	2	6	5986	5991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387615192
122	NC_017659	CAG	2	6	6094	6099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615192
123	NC_017659	GC	3	6	6120	6125	0 %	0 %	50 %	50 %	387615192
124	NC_017659	CCT	2	6	6212	6217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387615192
125	NC_017659	CTGTT	2	10	6224	6233	0 %	60 %	20 %	20 %	387615192
126	NC_017659	CGC	2	6	6252	6257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387615192
127	NC_017659	GGC	2	6	6282	6287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615192
128	NC_017659	TTC	2	6	6289	6294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387615192
129	NC_017659	GCA	2	6	6324	6329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615192
130	NC_017659	GCA	2	6	6354	6359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615192
131	NC_017659	CAGC	2	8	6365	6372	25 %	0 %	25 %	50 %	387615192
132	NC_017659	TGA	2	6	6384	6389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615192
133	NC_017659	ACT	2	6	6390	6395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615192
134	NC_017659	TCC	2	6	6434	6439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387615192
135	NC_017659	TGA	2	6	6462	6467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615192
136	NC_017659	GTC	2	6	6550	6555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615192
137	NC_017659	CACG	2	8	6615	6622	25 %	0 %	25 %	50 %	387615192
138	NC_017659	GAT	2	6	6652	6657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615192
139	NC_017659	TCG	2	6	6675	6680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615192
140	NC_017659	TAG	2	6	6717	6722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615192
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142	NC_017659	CGG	2	6	6855	6860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615192
143	NC_017659	CG	3	6	6904	6909	0 %	0 %	50 %	50 %	387615192
144	NC_017659	CTG	2	6	6931	6936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615192
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153	NC_017659	ATT	2	6	7292	7297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_017659	TCTT	2	8	8698	8705	0 %	75 %	0 %	25 %	387615194
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245	NC_017659	TAAT	2	8	11925	11932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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248	NC_017659	AT	3	6	12002	12007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
249	NC_017659	T	6	6	12016	12021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
250	NC_017659	ATC	2	6	12040	12045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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252	NC_017659	TA	3	6	12124	12129	50 %	50 %	0 %	0 %	387615196
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262	NC_017659	ATAG	2	8	12496	12503	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
263	NC_017659	TA	3	6	12558	12563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
264	NC_017659	AT	3	6	12657	12662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
265	NC_017659	TGC	2	6	12687	12692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615197
266	NC_017659	ATA	2	6	12701	12706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387615197
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403	NC_017659	A	7	7	18570	18576	100 %	0 %	0 %	0 %	387615204
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406	NC_017659	TAAAA	2	10	18599	18608	80 %	20 %	0 %	0 %	387615204
407	NC_017659	A	7	7	18669	18675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
408	NC_017659	AT	3	6	18684	18689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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466	NC_017659	TAA	3	9	21171	21179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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